1.水功能区污染物总量监控

计算水污染物需要大量的水质水量数据，而水质在线监测系统的频次较高，而且覆盖面较广，能够产生出来的运算数据较多，自动化对水质进行监控管理，并且可以设置污染物总量容差值，一旦超过容差值则会进行预警，从而很好地对水功能区污染物总量进行监控，从而促进水资源管理工作的资源化。

2.供水水源地水质监测

因为水源地对于老百姓用水的重要性，所以很多地区都会在水源地建设自动监测站，这样一来即可对水源地的水质进行全天不间断实时监测，一旦水源有任何异常，监测站就会发出预警，从而可以在第一时间对水源地进行安全有效的监督管理，保证老百姓用水安全。

3.预警预报重大水质污染事故

在对于预警预报重大水质污染事故上，水质监测系统肯定是具有得天独厚的优势，除了可以第一时间进行反馈预警之外，甚至于在发生重大水质污染事故之前，监测系统往往都可以通过水质中的杂质提前预测出可能会出现的污染事故，从而起到一定的杜绝作用。